Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms