Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms