Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRFP10586 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms