Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLI4P10075 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms