Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms