Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms