Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFLP07196 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms