Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNA6P05013 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms