Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms