Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAMTA2O94983 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAMTA2O94983 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms