Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KA4O75676 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms