Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms