Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASKO14936 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASKO14936 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASKO14936 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASKO14936 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASKO14936 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASKO14936 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms