Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHOX2AO14813 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms