Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APAF1O14727 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APAF1O14727 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APAF1O14727 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APAF1O14727 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms