Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms