Protein–RNA interactions for Protein: O00213

APBB1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB1O00213 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB1O00213 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB1O00213 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB1O00213 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms