Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BQ06 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BQ06 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BQ06 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BQ06 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms