Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms