Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms