Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC169A6NNP5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC169A6NNP5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC169A6NNP5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC169A6NNP5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms