Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms