Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAV26-1A0A087WT03 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAV26-1A0A087WT03 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAV26-1A0A087WT03 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAV26-1A0A087WT03 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAV26-1A0A087WT03 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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