Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
DCAF1Q9Y4B6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms