Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms