Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms