Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms