Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms