Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms