Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms