Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms