Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCTN4Q9UJW0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms