Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms