Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms