Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms