Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GDE1Q9NZC3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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