Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NDUFB11Q9NX14 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFB11Q9NX14 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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