Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBRD1Q9NUN5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms