Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms