Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP26Q9NRE1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms