Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AKIP1Q9NQ31 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms