Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms