Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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