Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms