Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms