Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC4A5Q9BY07 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms