Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms