Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms