Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNPPD1Q9BV87 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNPPD1Q9BV87 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms