Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms